Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Prkrip1Q9CWV6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prkrip1Q9CWV6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms