Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snw1Q9CSN1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Snw1Q9CSN1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snw1Q9CSN1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snw1Q9CSN1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snw1Q9CSN1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snw1Q9CSN1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snw1Q9CSN1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snw1Q9CSN1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snw1Q9CSN1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Snw1Q9CSN1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snw1Q9CSN1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snw1Q9CSN1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snw1Q9CSN1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snw1Q9CSN1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snw1Q9CSN1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snw1Q9CSN1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snw1Q9CSN1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snw1Q9CSN1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms