Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nicn1Q9CQM0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms