Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb3bpQ9CQ82 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms