Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms