Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pls3Q99K51 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms