Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Def8Q99J78 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms