Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms