Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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Afg3l1Q920A7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Afg3l1Q920A7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Afg3l1Q920A7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Afg3l1Q920A7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Afg3l1Q920A7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.6 ms