Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SncbQ91ZZ3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SncbQ91ZZ3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms