Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y12

Pcdha8, Protocadherin alpha 8, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha8Q91Y12 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcdha8Q91Y12 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdha8Q91Y12 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdha8Q91Y12 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdha8Q91Y12 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdha8Q91Y12 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdha8Q91Y12 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdha8Q91Y12 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms