Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usb1Q91W78 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms