Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms