Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms