Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Neil3Q8K203 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Neil3Q8K203 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Neil3Q8K203 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Neil3Q8K203 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Neil3Q8K203 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Neil3Q8K203 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Neil3Q8K203 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Neil3Q8K203 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Neil3Q8K203 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Neil3Q8K203 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Neil3Q8K203 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Neil3Q8K203 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Neil3Q8K203 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Neil3Q8K203 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms