Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms