Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp1Q8C8U0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp1Q8C8U0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp1Q8C8U0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp1Q8C8U0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp1Q8C8U0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp1Q8C8U0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp1Q8C8U0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp1Q8C8U0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp1Q8C8U0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp1Q8C8U0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp1Q8C8U0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp1Q8C8U0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfibp1Q8C8U0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms