Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Usp37Q8C0R0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Usp37Q8C0R0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Usp37Q8C0R0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Usp37Q8C0R0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Usp37Q8C0R0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Usp37Q8C0R0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Usp37Q8C0R0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Usp37Q8C0R0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Usp37Q8C0R0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Usp37Q8C0R0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Usp37Q8C0R0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Usp37Q8C0R0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp37Q8C0R0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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