Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms