Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra5Q8BHJ7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms