Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4dQ8BGV9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4dQ8BGV9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms