Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katnb1Q8BG40 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms