Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnf1Q7TSH7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms