Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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