Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vma21Q78T54 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms