Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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