Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rad54bQ6PFE3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad54bQ6PFE3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms