Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl2Q6PA06 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms