Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Z1

Smarcd3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd3Q6P9Z1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcd3Q6P9Z1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms