Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrig3Q6P1C6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrig3Q6P1C6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrig3Q6P1C6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrig3Q6P1C6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrig3Q6P1C6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrig3Q6P1C6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lrig3Q6P1C6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrig3Q6P1C6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms