Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szrd1Q6NXN1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms