Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema3cQ62181 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema3cQ62181 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema3cQ62181 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema3cQ62181 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema3cQ62181 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema3cQ62181 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sema3cQ62181 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema3cQ62181 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms