Protein–RNA interactions for Protein: Q61884

Mns1, Meiosis-specific nuclear structural protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mns1Q61884 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mns1Q61884 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mns1Q61884 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms