Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ifi47Q61635 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ifi47Q61635 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ifi47Q61635 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ifi47Q61635 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifi47Q61635 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ifi47Q61635 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Ifi47Q61635 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Ifi47Q61635 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifi47Q61635 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Ifi47Q61635 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifi47Q61635 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifi47Q61635 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifi47Q61635 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifi47Q61635 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifi47Q61635 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifi47Q61635 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifi47Q61635 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifi47Q61635 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi47Q61635 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi47Q61635 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi47Q61635 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi47Q61635 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi47Q61635 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi47Q61635 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifi47Q61635 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ifi47Q61635 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ifi47Q61635 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms