Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lamb3Q61087 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms