Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms