Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Neurod1Q60867 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Neurod1Q60867 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Neurod1Q60867 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Neurod1Q60867 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Neurod1Q60867 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Neurod1Q60867 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Neurod1Q60867 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Neurod1Q60867 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Neurod1Q60867 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Neurod1Q60867 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Neurod1Q60867 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Neurod1Q60867 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Neurod1Q60867 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Neurod1Q60867 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Neurod1Q60867 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Neurod1Q60867 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Neurod1Q60867 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Neurod1Q60867 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Neurod1Q60867 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Neurod1Q60867 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Neurod1Q60867 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms