Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam71bQ5STT6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms