Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Utp18Q5SSI6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Utp18Q5SSI6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms