Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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