Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlha9Q5RJB0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms