Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJS3

Fam20c, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20cQ5MJS3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam20cQ5MJS3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam20cQ5MJS3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms