Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WhammQ571B6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WhammQ571B6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms