Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opa3Q505D7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opa3Q505D7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms