Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep63Q3UPP8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep63Q3UPP8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms