Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Skap2Q3UND0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms