Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcgf5Q3UK78 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms