Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U1D9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U1D9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q3U1D9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U1D9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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