Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700066B19RikQ3TS39 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700066B19RikQ3TS39 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms