Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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